医院设有门诊综合科、风湿病科、针灸科、民族医学科4个临床科室;功能科、药剂科2个医辅科室;院办、财务科、医务科、后勤总务科、护理部、感控办、公卫办7个行政科室和1个佤医佤药研究所。为辖区内人口开展中西医门诊诊疗、中西医住院治疗、中医康复治疗、佤医药门诊诊疗等业务项目,同时承担佤医药发掘研究、传承及院内制剂的研发工作。